新宿三丁目で安い性病検査とおすすめクリニック 保険がほとんど使えない商圏【2026年9月】

新宿三丁目で性病検査を受けられるクリニックは5院あります。調べてまず目につくのは、この街ではほぼ保険が使えないことです。

2院は全額自費、1院は当面のあいだ自費診療のみと告知しています。1院は保険診療を一時休止したまま更新が止まっており、残る1院には性病検査の個別料金そのものがありません。症状があっても3割負担にならない前提で考えたほうがいい商圏です。

そのかわり、三丁目には他のエリアにない仕組みがあります。即日料金を取らず、午前中に行けば追加料金なしで当日結果が出るクリニックがあります。

料金がわかっている中でいちばん安いのは予防会 新宿クリニックの7,340円です。おすすめのクリニックは、保険を使えない前提で、当日に結果が要るか、夜しか行けないかで変わります。

この記事では5院の料金と結果までの時間を整理しました。金額と診療時間はすべて各院の公式サイトに掲載されている数字で、2026年9月15日に確認したものです。

三丁目は保険がほとんど使えない

院名	保険の扱い
予防会 新宿クリニック	全額自費（初診料もなし）
予防会 新宿サテライトクリニック	全額自費
ナイトレディースクリニック新宿	当面のあいだ自費のみと告知
深山会クリニック	保険診療を一時休止と告知（トップは「保険医療機関です」）
新宿東口クリニック	性病検査の個別料金がなく、ブライダルチェックの枠のみ

保険の相談に行っても自費になると告知している院がある

ナイトレディースクリニック新宿は、当面のあいだ、保険診療の相談で来院しても自費診療のみの対応になると公式に告知しています。症状があるから保険で受けようと考えて行くと、想定より支払いが増えます。

公式サイトの中で記述が食い違っている院がある

深山会クリニックは、トップページに「保険医療機関です」と書いています。ところが同じサイトのお知らせには、2022年11月29日付で「健康保険での診療を一時休止する」と掲載されており、それ以降の更新がありません。

現在どちらの状態なのかは公式からは読み取れません。保険を前提に行くなら、電話で確認してから向かってください。

検査がブライダルチェックの枠しかない院がある

新宿東口クリニックには性病検査の個別料金が存在しません。あるのは2つだけです。

メニュー	料金	内容
ブライダルチェック	20,000円	クラミジア・淋病・梅毒・肝炎・HIV
プチブライダルチェック	10,000円	上記から淋病を除いたもの

クラミジアだけ、淋菌だけという受け方ができません。淋病を調べたければ20,000円のほうを選ぶことになります。女性は綿棒での自己採取です。

保険で受けたいなら西新宿まで出たほうが早い

三丁目から新宿駅を越えて西口側へ出ると、保険の実額を公開している院があります。新宿駅前さくらレディースクリニックが約2,300円、新宿サザンクリニックが迅速検査で約1,900円（別途初診料約900円）です。

徒歩15分ほどの差で支払いが1万円近く変わる可能性があります。症状があって保険が使える状態なら、移動する価値があります。

即日料金を払わずに当日結果を受け取る方法がある

午前に行けば追加料金なしで当日わかる

予防会 新宿クリニックには「朝検（あさけん）」という仕組みがあります。午前の診療時間内に検査すれば、追加料金なしでその日のうちに結果が出ます。

即日オプションとして数千円を上乗せする院が多いなかで、この院は料金ではなく来る時間で速さが決まります。7つの商圏を調べた中で、この型はここだけです。

午後に行くと翌朝10時頃になる

裏を返すと、午後に検査した場合の結果は翌朝10時頃です。同じ料金を払っても、行く時間で半日以上変わります。仕事帰りに寄ると翌日になります。

午前の診療は10:30〜13:15です。ここに間に合うかどうかが分かれ目になります。

追加料金を払う通常の即日もある

もっと急ぐ場合、同じ院に迅速検査があります。約30分で結果が出ます。

迅速検査	料金
トリコモナス	1,580円
梅毒	3,370円
クラミジア	3,670円
淋菌	4,890円
HIV	5,500円
迅速の尿セット	8,760円

迅速検査の受付は月〜金が17:30まで、土曜が16:30までです。診療は18:00まで（土は16:45まで）なので、閉院時刻で判断すると間に合いません。

15分で出る項目がある

新宿東口クリニックは、HIVだけが15分で結果が出ます。その他の項目は約5日です。HIVの不安を今日消したいという目的に限れば、この院が最短になります。

感染の機会から何日たてば検査できるのか

検査できるようになる時期は病気ごとに違う

心当たりがあった翌日に検査しても、正しい結果は出ません。病原体が体内で増えて検出できる量になるまで、病気ごとに必要な時間があります。

淋菌とクラミジアは比較的早く、24時間から数日で検査できるようになります。一方で梅毒とHIVは数週間から1か月以上あける必要があります。新宿圏では、HIVを4週間経過後としている院と2か月としている院があります。

症状が出ないまま進む病気がある

クラミジアは、特に女性でほとんど症状が出ないことがあります。男性でも軽い違和感で済んでしまい、気づかないまま人にうつすことがあります。

淋菌は男性では排尿時の強い痛みと膿という分かりやすい症状が出ますが、のどの感染では喉の軽い痛み程度で、風邪と区別がつきません。症状がないことは、感染していないことの証明になりません。

早すぎる検査は陰性でも安心材料にならない

検査できる時期より前に受けて陰性が出ても、それは「まだ検出できない」という意味かもしれません。心当たりの直後に受けた陰性は、期間をあけてもう一度受け直す前提で考えてください。

これは料金の問題に直結します。三丁目は自費の商圏なので、受け直すたびに全額がかかります。最初に受ける時期を間違えると倍の出費になります。

来院前に排尿を1時間我慢する必要がある

予防会 新宿クリニックは、男性は排尿を1時間我慢して来院するよう公式に書いています。直前にトイレを済ませると尿の検体が取れず、出直しになります。

新宿三丁目で安いのはどこか。おすすめは料金が公開されている院

5院のうち自費2項目の金額を公開しているのは予防会の2院だけです。残る3院は非公開かセット料金のみで、総額が読めません。金額を確かめてから行きたいなら、予防会の7,340円がおすすめの出発点になります。

院名	最寄り	自費2項目	即日	保険
予防会 新宿クリニック	新宿駅東口 徒歩3分	7,340円	朝検は無料。迅速は約30分	なし
予防会 新宿サテライトクリニック	同ビル7F	本院と同額	—	なし
ナイトレディースクリニック新宿	新宿3-17-22	公式に記載なし	約2〜3時間でスマホ確認	当面は自費のみ
新宿東口クリニック	地下通路B6出口直結	個別料金なし（2万円のセットのみ）	HIVは15分、他は約5日	記載なし
深山会クリニック	新宿三丁目駅C6 徒歩1分	非公開	記載なし	一時休止と告知

予防会の料金は渋谷や川崎と1円も違わない

予防会の検査料金は、渋谷・川崎・池袋サテライト・新宿のどの院でも同じです。クラミジア3,670円、淋菌3,670円で2項目7,340円。三丁目で高いということも、安いということもありません。

系列の院を選ぶ場合、料金で比べる意味がないということです。選ぶ基準は立地と診療時間になります。

セットは以下のとおりです。

セット	料金
セットC（クラミジア・淋菌・カンジダ）	6,300円
のど検査セット	6,300円
はじめての検査セットLight	8,300円
血液Aセット	8,920円
撮影用お仕事セット	14,260円
まとめてセット	22,200円
まとめて安心セット	27,000円
まとめて安心plus	33,000円

初診料はかかりません。表の金額がそのまま支払額になります。

料金がわからない院が2つある

深山会クリニックは料金ページ自体が存在せず、性病検査の金額が一切公開されていません。性感染症内科として、クラミジア・ヘルペス・淋病・梅毒・カンジダ・トリコモナス・HIVなどを掲げていますが、いくらかかるかは受診してみないとわかりません。

新宿東口クリニックは前述のとおり、2万円と1万円のセットしかありません。この2院は、行く前に総額を見積もれません。

夜と休日に開いているクリニック

22時まで開く婦人科がある

ナイトレディースクリニック新宿は夜22時まで診療しています。新宿圏の女性向けでは最も遅い時間です。

曜日	診療時間
月	休診
火	15:00-18:00／19:00-22:00
水木金	11:00-13:45／15:45-22:00
土	19:00-22:00
日	診療
祝	11:00-13:45／15:45-22:00

精密検査（PCR・抗体）の結果は約2〜3時間でスマホから確認できます。なお診療時間は2026年2月と3月に変更されています。

日曜も祝日も開いている院

予防会 新宿サテライトクリニックは月曜から日曜まで毎日10:30〜12:15と14:00〜18:45で、休診は祝日だけです。日曜に検査を受けたい場合の選択肢になります。予約制ではなく直接来院する方式です。

ナイトレディースクリニック新宿は日曜も祝日も診療しています。この2院で、日曜と祝日の両方がカバーされます。

朝9時から開いている院

深山会クリニックは月曜から土曜まで9:00〜13:00、月〜金は14:30〜18:30も診療しています。新宿三丁目駅のC6エレベーター出口から徒歩1分、1階が松屋のビルの9階です。三丁目でいちばん早い時間から開いています。予約制ではありません。

最終受付が診療終了より前に締まる

ナイトレディースクリニック新宿は、最終受付が診療終了の15分前です。さらに視診・採血検査・注射処置・治療は30分前までと分かれています。22時まで開いていても、採血は21:30までということです。

予防会 新宿クリニックの迅速検査も、前述のとおり受付が17:30（土16:30）で締まります。

撮影や仕事で証明が必要なとき

撮影用お仕事セットがある

予防会 新宿クリニックには撮影用お仕事セット14,260円があります。業界向けのメニューを明示的に持っている院は三丁目ではここだけです。

歌舞伎町とは条件が正反対になっている

ただし条件が厳しめです。予防会は顔写真付きの身分証明書の提示が必要です。

歩いて10分ほどの歌舞伎町では、新宿カブキ検査クリニックとUBCLINIC新宿東口がどちらも在籍証明を求めません。同じ新宿でありながら、本人確認の考え方が真逆です。

顔写真付きの身分証を出せるなら三丁目、出したくないなら歌舞伎町、という選び分けになります。

ヘルペスとコンジローマは診察の方法が男女で違う

予防会のセットに含まれるヘルペスと尖圭コンジローマは、男性が外診、女性は内診（クスコを使用）です。女性の場合は内診台に上がる前提なので、時間と心構えが要ります。

女性が受診するとき

夜遅くまで開いている婦人科がある

三丁目の強みは、女性が夜に行ける場所があることです。ナイトレディースクリニック新宿は婦人科と性病科を掲げ、22時まで診療しています。西新宿の婦人科は新宿レディースクリニックが19:00、ふるかわクリニックが19:30までなので、新宿圏で最も遅くまで開いている婦人科です。

女医に無料で相談できる

予防会 新宿クリニックは女医による無料相談を用意しています。どの検査を受けるべきかわからない段階で相談できます。

内診を伴う検査がある

前述のとおり、ヘルペスとコンジローマの検査は女性の場合クスコを使う内診になります。尿やおりものの検体だけで済む検査とは負担が違うので、予約時に確認してください。

のどと肛門の検査

のど検査セットは6,300円

オーラルセックスでうつる咽頭のクラミジアと淋菌は、性器とは別に検体を取ります。予防会 新宿クリニックののど検査セットが6,300円です。

三丁目でのどの料金を公開しているのは予防会だけです。他の3院はセット料金に含むか、料金自体が非公開です。

肛門まわりに症状があるとき

新宿二丁目に新宿おしりのクリニックがあります。新宿三丁目駅C8出口から徒歩1分。肛門外科と性感染症外科を掲げ、治療はすべて保険適用と明記しています。三丁目商圏で保険が使えるほぼ唯一の場所です。

ただし対象は尖圭コンジローマ・HIV・梅毒に限られ、クラミジアや淋菌の検査メニューを持っていません。いぼができた、痛みがあるといった肛門の症状がある場合の受け皿であって、性病検査そのものを受ける場所ではありません。

陽性だったときにどうなるか

淋菌の点滴治療はサテライトに回される

予防会で淋菌が陽性だった場合、点滴による治療は新宿サテライトクリニックで行います。本院と同じビルの7階です。美容注射やサプリメントも本院からサテライトに回されます。

同じ系列でも院によって扱うメニューが違うので、最初からサテライトに行けば済む場合もあります。

治療まで含めて自費になる

三丁目は検査が自費なので、陽性だった場合の治療も自費です。検査で7,340円、治療でさらに数千円から1万円前後かかります。保険なら治療薬が1,000円前後で済む院が西新宿にあることを考えると、差は小さくありません。

料金が非公開の院では総額が読めない

深山会クリニックと新宿東口クリニックは、陽性だった場合の治療費も公開していません。検査だけでなく治療まで含めた総額が、受診するまでわからないということです。

クリニックに行かずに調べる方法

郵送の検査キットという選択肢がある

自宅で検体を採取して郵送する検査キットがあります。三丁目は自費で1万円前後かかる商圏なので、その金額を出すならキットでいいのではないかと考える人は多いはずです。

キットの利点は、クリニックに行かなくていいこと、対面で話さなくていいこと、そして時間の制約がないことです。

キットでわかること、わからないこと

一方で限界もあります。検体の採取を自分で行うため、取り方が不十分だと正しい結果が出ません。クリニックなら医療者が採取するか、採取方法の指導を受けられます。

また、目で見て判断する必要がある病気は郵送では調べられません。尖圭コンジローマやヘルペスは、医師が見ないと診断できません。予防会が男性は外診、女性は内診としているのはそのためです。

陽性なら結局クリニックに行くことになる

最も大きな違いは、キットは治療できないことです。陽性が出たら、結局クリニックを受診して薬をもらうことになります。

その場合、検査代と診察代の両方を払うことになります。症状がすでに出ているならキットを挟む意味は薄く、最初からクリニックに行ったほうが早く安く済みます。症状がなく、念のため確認したいだけならキットで足ります。

新宿三丁目のクリニック

予防会 新宿クリニック

新宿3-22-11 RSビル9F。新宿駅東口から徒歩3分。電話は03-5360-6024。公式サイトは予防会 新宿クリニック。

10:30〜13:15と15:00〜18:00（土曜は14:30〜16:45）。初診料なし、全額自費。

クラミジア（TMA法）3,670円、淋菌3,670円で2項目7,340円。迅速の尿セットが8,760円。朝検により、午前の診療時間に検査すれば追加料金なしで当日中に結果が出ます。午後の検査は翌朝10時頃。迅速検査は約30分で、受付は月〜金17:30まで、土16:30までです。

撮影用お仕事セット14,260円には顔写真付き身分証明書の提示が必要。ヘルペス・コンジローマは男性が外診、女性は内診（クスコ使用）です。男性は排尿を1時間我慢して来院するよう明記されています。女医による無料相談あり。緊急避妊薬のレボノルゲストレルが7,700円、ED薬はバイアグラ1,370円、シアリス10mgが1,580円です。

予防会 新宿サテライトクリニック

同じRSビルの7F。電話は03-5366-5607。公式サイトは予防会 新宿サテライトクリニック。

月曜から日曜まで10:30〜12:15と14:00〜18:45。日曜も診療しており、休診は祝日のみです。予約制ではなく直接来院します。

検査料金は本院と同じです。淋菌の点滴治療はこちらで行います。美容注射やサプリメントも本院からこちらに回されます。

新宿東口クリニック

新宿3-17-5 T&TⅢビル6F。地下通路のB6出口直結。電話は03-5366-3389。公式サイトは新宿東口クリニック。院長は山中晃医師。

平日10:00〜14:00と15:30〜19:30、土曜10:00〜14:00、日祝休診。月に1〜2回の休日診療があります。

新宿で50年続く医院で、2021年7月に新宿通りの紀伊國屋書店隣へ移転しました。性病検査の個別料金はなく、ブライダルチェック20,000円（クラミジア・淋病・梅毒・肝炎・HIV。女性は綿棒で自己採取）とプチブライダルチェック10,000円（淋病が入らない）の2つだけです。HIVは15分、その他は約5日。匿名希望可で、結果をメールで受け取れます。

ナイトレディースクリニック新宿

新宿3-17-22 SOUTHERN REAL TERRACE 5階。婦人科・性病科。公式サイトはナイトレディースクリニック新宿。

月曜休診。火曜15:00〜18:00と19:00〜22:00、水木金11:00〜13:45と15:45〜22:00、土曜19:00〜22:00、日祝も診療（祝日は11:00〜13:45と15:45〜22:00）。最終受付は診療終了の15分前、視診・採血検査・注射処置・治療は30分前まで。

当面のあいだ、保険診療の相談で来院しても自費診療のみの対応と告知しています。精密検査（PCR・抗体）の結果は約2〜3時間でスマホから確認できます。診療時間は2026年2月と3月に変更されました。夜22時まで開く婦人科として、新宿圏の女性向けでは最も遅い時間まで診ています。

深山会クリニック

新宿3-11-11 ダイアン新宿ビル9F。新宿三丁目駅C6エレベーター出口から徒歩1分。電話は03-3341-1007。公式サイトは深山会クリニック。医療法人社団深山会。

月〜土9:00〜13:00、月〜金14:30〜18:30。土曜午後と日祝が休診。予約制ではありません。1階が牛丼の松屋、丸井MENの向かいのビルです。

性感染症内科として、クラミジア・ヘルペス・淋病・梅毒・カンジダ・トリコモナス・ガードネラバギナーリス・HIV、膀胱尿道炎・精巣上体炎・前立腺炎・膣炎などを診療対象に挙げています。ただし料金ページが存在せず、性病検査の金額は一切公開されていません。即日の記載もありません。

保険については、トップページに「保険医療機関です」とある一方、お知らせでは2022年11月29日付で健康保険での診療を一時休止すると告知されたまま更新がありません。

新宿おしりのクリニック（肛門の症状があるとき）

新宿2-12-4 アコード新宿ビル8階。新宿三丁目駅C8出口から徒歩1分。電話は03-6384-1232。公式サイトは新宿おしりのクリニック。医療法人吉幸会、院長は吉田幸平医師。2021年10月開業。

月〜土10:00〜13:00、月火水金15:00〜18:00（木・土は午前のみ）、日祝休診。予約不要で、新患は受付終了の30分前までに来院します。

肛門外科が主軸で、性感染症外科の対象は尖圭コンジローマ・HIV・梅毒です。クラミジアや淋菌の検査メニューはありません。治療はすべて保険適用と明記しています。

三丁目で受けられないときの選択肢

徒歩圏に3つの商圏がある

三丁目の5院が条件に合わない場合、歩いて行ける範囲に別の選択肢があります。

新宿駅の反対側に出れば西新宿に9院あり、自費2項目が1,980円から、保険なら約2,300円から受けられます。三丁目で唯一手に入らない「保険」がある商圏です。北へ歩けば歌舞伎町に4院あり、90分で結果が出る院や、在籍証明なしで業界向けの検査を受けられる院があります。新宿駅東口にも5院あります。

新宿三丁目から行ける無料・匿名の性病検査

東京都新宿東口検査・相談室が西武新宿駅前にあります。HIVと梅毒の通常検査を匿名・無料で受けられ、予約制です。受付は月〜金が15:00〜20:00、土日が13:00〜17:00。祝日・振替休日・年末年始は休みで、毎週水曜日は女性のための検査日です。

ここで淋菌とクラミジアを調べられるのは、6月1日〜6月30日と11月16日〜12月15日の期間の希望者だけです（尿検査）。希望する人は検査の前日までに採尿セットを受け取りに行く必要があり、女性のための検査日の水曜日は男性への受け渡しがありません。詳しくは東京都保健医療局の案内で確認してください。

もうひとつ、新宿区保健所の検査ではクラミジアも無料・匿名で調べられます。会場は東新宿保健センター（新宿7-26-4 2階、東新宿駅A2出口から徒歩3分）で、HIV検査に希望で梅毒・クラミジア（尿）・B型肝炎を同時に受けられます。淋菌は対象外です。予約はオンラインか電話（03-5273-3859）で検査日の前日まで、結果は1週間後に口頭で伝えられます。日程は新宿区の公式ページで確認してください。

症状だけでどの性病かを自分で判断するのは難しいものです。どこを受診すればよいか迷う場合は、DMMオンラインクリニックなどのオンライン診療で医師に相談する方法もあります（診察料0円）。ただし、オンラインで治療できるのはクラミジア・性器ヘルペス・トリコモナス・ウレアプラズマ・カンジダに限られ、淋菌や梅毒は対面の医療機関で治療を受けることになります。また、検査結果がない場合は、適切な治療ができないこともあります。

新宿三丁目の性病検査でよくある質問

今日中に結果を知りたいのですが

予防会 新宿クリニックの午前（10:30〜13:15）に行ってください。朝検により追加料金なしで当日中に結果が出ます。午後になると翌朝10時頃です。もっと急ぐなら同院の迅速検査が約30分ですが、受付は月〜金17:30まで、土16:30までです。

症状があるので保険を使いたいです

三丁目ではほぼ使えません。予防会は全額自費、ナイトレディースクリニック新宿は当面自費のみと告知、深山会クリニックは保険診療を一時休止と告知したまま更新がありません。保険で受けたいなら、新宿駅の西側へ出て新宿サザンクリニック（迅速検査が約1,900円、別途初診料約900円）や新宿駅前さくらレディースクリニック（約2,300円）を検討してください。

夜しか時間が取れません

ナイトレディースクリニック新宿が22時まで（水木金は11:00〜13:45と15:45〜22:00）診療しています。ただし採血や処置は診療終了の30分前までなので、実質21:30が締め切りです。新宿東口クリニックは平日19:30まで、予防会サテライトは18:45までです。

クラミジアだけ調べたいのですが、安いのはどこですか

予防会 新宿クリニックなら3,670円です。新宿東口クリニックでは単品で受けられず、10,000円か20,000円のセットになります。深山会クリニックは料金が公開されていません。

心当たりが昨日なのですが、もう検査できますか

淋菌とクラミジアは比較的早く検査できますが、梅毒とHIVは数週間から1か月以上あける必要があります。早すぎる時期の陰性は「まだ検出できない」だけかもしれません。三丁目は自費の商圏なので、受け直すと全額がもう一度かかります。受ける時期を先に確認してください。

顔写真付きの身分証を出したくありません

予防会の撮影用お仕事セットは顔写真付き身分証明書の提示が必要です。歌舞伎町の新宿カブキ検査クリニックとUBCLINIC新宿東口は在籍証明を求めません。歩いて10分ほどなので、証明書を出したくない場合はそちらが選択肢になります。

肛門にいぼのようなものができました

新宿の他の商圏は新宿駅東口の性病検査、西新宿の性病検査、歌舞伎町の性病検査にまとめています。緊急避妊薬を探している場合は新宿三丁目のアフターピルをご覧ください。

新宿二丁目の新宿おしりのクリニックが尖圭コンジローマを扱っており、治療は保険適用です。新宿三丁目駅C8出口から徒歩1分。ただしクラミジアや淋菌の検査は行っていないので、他の性病もまとめて調べたい場合は予防会と使い分けることになります。

近くの街の性病検査

近くの街で性病検査を受ける場合は、次の記事にまとめています。

• 東京の性病検査 安いおすすめの街と保健所の無料【2026年9月】